Biografia
Matteo Pallocca è un Bioinformatico con esperienza in Genomica del Cancro e DATA FAIRification. Ha coordinato la facility di Bioinformatica dell’Istituto Nazionale Tumori Regina Elena fino al 2023. Attualmente impegnato come Data Engineering Coordinator per il network di Biobanche Italiane (BBMRI.it) al CNR, verso un’infrastruttura di analisi -omiche federate.
Abstract
Implementazione di un Framework per la Maturità Digitale per il Biobancaggio
Le biobanche devono garantire un processo completamente ingegnerizzato e digitalizzato verso la FAIRificazione dei dati e la riproducibilità scientifica. A tale scopo, il primo passo è valutare lo stato attuale della digitalizzazione con metriche quantitative, il che risulta particolarmente impegnativo date le molteplici sfaccettature regolatorie e logistiche del biobanking. Presentiamo BB4FAIR, un framework di valutazione della maturità digitale delle biobanche italiane. Esso comprende 1) un sondaggio con 38 domande suddivise in tre macro aree, ovvero infrastruttura IT, personale e ricchezza di annotazione dei dati; 2) un sistema R automatizzato per l'analisi e la visualizzazione dei risultati del sondaggio.
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Bio
Matteo Pallocca is a Computer Scientist with a strong background on Bioinformatics, Cancer Genomics and Data FAIRification. He coordinated the Bioinformatics analysis at Regina Elena National Cancer Institute up to 2023, and he is currently Data Engineering coordinator for the network of Italian Biobanks (BBMRI.it) at CNR, currently working towards federated -omics analysis.
Abstract
Implementation of a Digital Maturity Framework for Biobanking
Biobanks must ensure a fully engineered and digitalized process towards data FAIRification and overall scientific reproducibility. To this aim, the first step is to assess the current digitalization status with quantitative metrics, which is particularly challenging given the multi-faceted regulatory and logistics aspects of biobanking. We present a Biobanking digital assessment maturity framework, BB4FAIR. It comprises 1) a survey with 38 questions divided in three macro areas, namely IT infrastructure, personnel, and data annotation richness; 2) an automated R system to analyse and produce data visualization based on the survey results.
Attribuzione 4.0 Internazionale